12-й Санкт-Петербургский Венозный форум
«АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ ФЛЕБОЛОГИИ»
Материалы

28 ноября -30 ноября 2019,
Санкт-Петербург

Содержание:

Первое крупномасштабное исследование генетических основ варикозной болезни нижних конечностей на основе данных биобанка Великобритании

Шадрина А.С.^1,2, Шарапов С.Ж.^1,2, Шашкова Т.И.^1,3,4, Цепилов Я.А.^1,2

1 - Новосибирский государственный университет, Новосибирск, Россия;
2 - Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия;
3 - Институт проблем передачи информации имени А. А. Харкевича РАН, Москва, Россия;
4 - Московский физико-технический институт, Москва, Россия;
weiner.alexserg@gmail.com

Введение. Наследственность является хорошо известным фактором риска варикозной болезни нижних конечностей (ВБНК). Выявление генов, варианты которых влияют на риск заболевания, позволяет получить новые знания о его патогенезе и создавать задел для будущей разработки лекарственных препаратов. Сегодня ценным источником данных для генетических исследований являются биобанки, содержащие генетическую и клиническую информацию от тысяч пациентов. Целью настоящей работы было изучение генетических основ ВБНК используя данные Биобанка Великобритании.

Методы. Материалом для исследования служили генетические данные 408455 человек, представленные в открытых базах данных Gene ATLAS и the Neale Lab – 10861 пациентов, имеющих диагноз ВБНК (код МКБ-10: I83), и 397594 пациентов без этого диагноза. Исследование состояло из двух этапов:

полногеномный анализ ассоциаций, выявляющий локусы генома, связанные с риском заболевания,
последующий биоинформатический анализ, в который входила приоритизация генов и процессов, значимых для развития ВБНК, а также поиск причинно-следственных связей между ВБНК и рядом других заболеваний и признаков методом Менделевской рандомизации (с использованием генетических вариантов в качестве инструментальных переменных).

Результаты. В настоящем исследовании было выявлено 12 генетических локусов, ассоциированных с риском ВБНК с высоким уровнем статистической значимости (P < 5*10-9).

Для 9 из этих локусов удалось приоритизировать гены, наиболее вероятно влияющие на ВБНК: CASZ1, PIEZO1, PPP3R1, EBF1, STIM2, HFE, GATA2, NFATC2 и SOX9. Эти гены связаны с развитием и ремоделингом сосудов и организацией внеклеточного матрикса, участвуют в воспалительном ответе, регуляции кровяного давления и метаболизме железа. Наиболее значимые сигналы ассоциации были получены для генов CASZ1 и PIEZO1. Белок, кодируемый геном CASZ1, принимает участие в развитии сердца и сосудов. Важность процессов развития для последующего формирования ВБНК была продемонстрирована также в «анализе обогащения генных наборов», который выявил категории «аномальный васкулогенез» и «аномальное развитие сосудов». Ген PIEZO1 кодирует ионный канал. Ранее было показано, что, находясь в клетках эндотелия, PIEZO1 способен улавливать напряжение сдвига при движении крови и преобразовывать его в биологический сигнал, меняющий структуру кровеносного сосуда. Помимо генов, в настоящей работе изучалась роль и негенетических факторов. Анализ причинно-следственных связей между ВБНК и 2221 признаком выявил прямое влияние на риск ВБНК следующих факторов: рост (независимо от веса), избыточный вес, а также уровень двух белков в плазме – MICB и CD209. Оба белка имеют отношения к иммунной системе.

Выводы. Выявленные гены и белки в перспективе могут быть интересны в качестве терапевтических мишеней. Поскольку наша работа было полностью биоинформатической (in silico), требуются дальнейшие экспериментальные исследования для валидации роли выявленных молекул в патогенезе ВБНК.

| Сайт конференции | Программа конференции | Тезисы конференции в формате PDF |

Авторский указатель

Абдуллаев Ф.Х.: 074

Агаджанян К.В.: 024

Агаларов Р.М.: 001 045

Агеев А.Г.: 083

Айкашев И.: 038

Аиткулов А.И.: 001

Алимухамедов Д.Д.: 047

Алонцева Н.Н.: 087

Андожская Ю.С.: 002

Антонюк-Кисиль В.Н.: 003

Аркадан Н.Р.: 017

Асамов Р.Э.: 004 005 006

Ахмедьянов И.А.: 078

Ахметзянов Р.В.: 007 008 009 010 011

Ацапина Ю.: 038

Батаев Г.В.: 081

Баширов Я.А.: 061

Бебуришвили А.Г.: 012 013

Бегларян Э.: 038

Бекназаров Ш.А.: 047

Беленцов С.М.: 014

Беллер А.В.: 080

Белокрылова Ю.Г.: 080

Березко М.П.: 083

Беспаев А.Т.: 022

Бессмертнов О.А.: 078

Бирюков А.В.: 082

Богачев В.Ю.: 015 017 028 033

Богомолов М.С.: 017

Богомолова В.В.: 017

Болдин Б.В.: 015

Боровиков Э.В.: 080

Борсук Д.А.: 076

Бредихин Р.А.: 007 008 009 010 011 018

Бубнова Н.А.: 019

Буриева Ш.М.: 027

Бурлева Е.П.: 020 075

Бурумкулов Е.Р.: 022

Буторин С.П.: 023 024 025

Буторина Н.С.: 023 024 025

Волков А.М.: 026

Володюхин М.Ю.: 007 008 011 018

Воронков А.А.: 082

Гаибов А.Д.: 027

Галимов Т.Р.: 078

Гамзатов Т.Х.: 026

Гармаш А.И.: 052

Гармаш Р.А.: 052

Гасанов З.Б.: 022

Гасников А.В.: 077

Гицук Я.В.: 046

Гордеев Н.А.: 065

Гостев А.А.: 033

Гришин С.В.: 046

Губанова Т.А.: 039 042

Гульмурадов У.Т.: 066

Гусинский А.В.: 026

Густелев Ю.А.: 045

Дадамьянц Н.Г.: 004

Деев Р.В.: 045

Джаборов Х.А.: 066

Джалалов Ф.З.: 047

Дженина О.В.: 015 028

Дзюбановский И.Я.: 003

Дивакова Т.С.: 048

Долгов С.И.: 083

Дроздова И.В.: 058 085 087

Ельшин Е.Б.: 039 040 041 042

Емельяненко В.М.: 059 085 087

Енин Е.А.: 022

Ерофеев Н.П.: 019

Еникеева В.Н.: 003

Жданович К.В.: 073

Желкомбаева М.А.: 081

Зейдлиц Г.А.: 033

Землянский В.В.: 071

Злобин О.В.: 057

Ибрагимов Д.Р.: 078

Иванов А.В.: 078

Иванов Е.В.: 029

Иванов М.А.: 073

Игнатенко П.В.: 051

Исаев А.М.: 043

Истранов А.Л.: 090

Йулдошев А.: 004 005 006

Кавецци А.:

Калашникова О.И.: 057

Калинин И.О.: 052

Калинин Р.Е.: 031 032

Калинин С.С.: 054

Канцуров Р.Н.: 060

Капериз К.А.: 033 062

Капустин С.И.: 065

Карнаухов Н.С.: 036

Карпенко А.А.: 033 051

Кательницкая О.В.: 036

Кательницкий И.И.: 035 036

Каторкин С.Е.: 041

Ким Д.Л.: 047

Кит О.В.: 036

Климчук И.П.: 054 055

Комарова Л.Н.: 038

Комиссаров В.В.: 055

Комиссаров К.А.: 065

Кордзахия Г.Э.: 055

Кременевский О.М.: 020

Кривощеков Е.П.: 039 040 041 042

Кузнецова Д.В.: 079

Кулов З.М.: 018

Купатадзе Д.Д.: 052

Курбанов С.П.: 066

Кутидзе И.А.: 043

Кутько А.П.: 048

Кучерук Е.Ф.: 003

Ларионов А.А.: 083

Лебедева Е.И.: 071

Лещинская А.Ю.: 020

Ливадняя Е.С.: 035

Липный В.М.: 003

Личнер С.И.: 003

Мазайшвили К.В.: 001 045

Макаров И.Г.: 053

Максаев Д.А.: 032

Малахов А.М.: 062 063

Малясев Д.В.: 018

Манджикян О.П.: 043

Маркин С.М.: 001 045 046

Махмудов Б.Й.: 004 005 006

Мжаванадзе Н.Д.: 031

Минаев В.П.: 033 062

Минеева Н.В.: 065

Минигалеева Э.Р.: 078

Митрофанов В.О.: 051

Мордовин А.И.: 046

Муминов Ш.М.: 047

Надвиков А.И.: 077

Наталинов Р.В.: 061

Небылицин Ю.С.: 048

Негода Т.Н.: 051

Немирович М.В.: 035

Нестеров С.С.: 012 013

Неъматзода О.: 027

Нимаев В.В.: 065

Новикова А.С.: 002

Новикова О.А.: 033

Нургалиев Н.С.: 022

Нуридинзода Н.Н.: 049

Овчаренко Д.В.: 082

Олейник Б.А.: 078

Омаров А.С.: 071

Онгарбаев Б.Т.: 022

Онохина М.Е.: 020

Папаян Л.П.: 065

Парманов А.Т.: 071

Пиханова Ж.Н.: 073

Поваров В.О.: 031

Подколзин Е.В.: 083

Попов В.А.: 023 024 025

Попова И.В.: 051

Прокопец А.И.: 057

Раповка В.Г.: 051

Раскин В.В.: 062 063

Рачков М.А.: 085 087

Рева Г.В.: 052

Рева И.В.: 052

Ржеусская М.Г.: 072

Ровная А.В.: 053

Роговой Н.А.: 054 055

Романов В.Е.: 039 040 041 042

Росуховский Д.А.: 057

Рыбаков Г.В.: 002

Рязанова И.И.: 012 013

Саая Ш.Б.: 051

Сабельников В.В.: 057

Сагандыков И.Н.: 071

Садовский А.В.: 065

Самко К.В.: 073

Санников А.Б.: 058 059 085 087

Сапелкин С.В.: 043

Сапронова Н.Г.: 060

Светова Э.В.: 060

Святовец С.С.: 061

Сейдалиев А.И.: 006

Семенов А.Ю.: 062 063

Сильчук Е.С.: 083

Смагин М.А.: 065

Смирнов О.А.: 075

Сокиренко И.А.: 035

Соколов А.В.: 081

Солдатенков В.Е.: 065

Солдатенкова О.В.: 065

Солиев О.Ф.: 049 066

Солуянов М.Ю.: 065

Сорокваша И.Н.: 089

Софинская Г.В.: 068

Стародубцев В.Б.: 051

Старостина А.А.: 068

Стояров С.А.: 068

Султаналиев Т.А.: 022 069 071

Султанов Д.Д.: 066

Султанов Дж.Д.: 049

Сучков И.А.: 031 032

Сушков С.А.: 071 072

Темиров С.Н.: 074

Темурзиева Х.М.: 073

Тимощук Ж.М.: 003

Тулемисов А.К.: 069 071

Турсунов Б.З.: 074

Турсынбаев С.Е.: 022

Тюрин С.А.: 075

Убайдуллаева В.У.: 005

Улимбашева З.М.: 082

Усманов Х.Х.: 074

Фасхиев Р.Р.: 075

Федоров Д.А.: 033 062 063

Федюшкина А.И.: 012 013

Фейсханов А.К.: 053

Фокин А.А.: 076 077

Хамидов Б.П.: 047

Хасенов Д.Т.: 071

Хафизов А.Р.: 078

Хисамутдинов Д.А.: 077

Хорев Н.Г.: 079 080 081

Хрыщанович В.Я.: 054

Хубулава Г.Г.: 082

Цепилов Я.А.: 084

Чебан А.В.: 035

Чернооков А.И.: 083

Черноусов В.В.: 077

Чиналиев А.М.: 069 071

Шадрина А.С.: 084

Шайдаков Е.В.: 021 058 085 086

Шалдина М.В.: 076

Шарапов С.Ж.: 084

Шарипов А.С.: 022

Шаталов А.В.: 012 013

Шашкова Т.И.: 084

Шевчук Р.И.: 083

Шилов Д.А.: 078

Шойхет Я.Н.: 079 080 081

Шукуров Б.И.: 004 005 006

Шумков О.А.: 065

Щеглов Э.А.: 087

Юнусов Х.А.: 066

Юров А.Ю.: 088

Юхневич К.С.: 001

Якушкин С.Н.: 089 090

Янушко В.А.: 054 055

Первое крупномасштабное исследование генетических основ варикозной болезни нижних конечностей на основе данных биобанка Великобритании

Шадрина А.С.1,2, Шарапов С.Ж.1,2, Шашкова Т.И.1,3,4, Цепилов Я.А.1,2

Шадрина А.С.^1,2, Шарапов С.Ж.^1,2, Шашкова Т.И.^1,3,4, Цепилов Я.А.^1,2